Мы провели открытое перекрестное исследование, чтобы проверить, влияют ли ингибиторы протонной помпы (ИПП) на микробиом желудочно-кишечного тракта, способствуя инфекции Clostridium difficile (CDI). Двенадцать здоровых добровольцев сдали по 2 исходных образца кала с интервалом в 4 недели (на 0-й и 4-й неделях). Затем они принимали ИПП в течение 4 недель (40 мг омепразола два раза в день), а на 8-й неделе были взяты образцы кала. Шесть человек принимали ИПП в течение дополнительных 4 недель (с 8-й по 12-ю неделю), а образцы фекалий были взяты у всех испытуемых на 12-й неделе. Образцы были проанализированы с помощью секвенирования гена 16S рибосомной РНК.
Мы не обнаружили существенных внутрииндивидуальных различий в разнообразии микробиома, когда сравнивали изменения во время исходного уровня по сравнению с изменениями на ИЦП.
Однако во время использования ИЦП произошли значительные изменения в таксонах, связанных с CDI (увеличение энтерококковых и стрептококковых, уменьшение клостридий), и таксонах, связанных с избыточным ростом бактерий в желудочно-кишечном тракте (увеличение микрококковых и стафилококковых). При функциональном анализе не было обнаружено изменений в желчных кислотах при ИПП, но наблюдалось увеличение генов, участвующих в бактериальной инвазии.
Эти изменения могут обеспечить механизм, с помощью которого ИПП предрасполагают к CDI. ClinicalTrials.gov ИДЕНТИФИКАТОР NCT01901276.
Авторы исследования: Daniel E Freedberg, Nora C Toussaint, Sway P Chen, Adam J Ratner, Susan Whittier, Timothy C Wang, Harris H Wang, Julian A Abrams
Отзывы пациентов на omeprazole