Хотя микробиом изменяется при различных заболеваниях пищевода, нет прямых доказательств связи между микробиомом полости рта или пищевода и подлежащей пищеводной тканью. Здесь мы стремились устранить эти пробелы с помощью антимикробного ополаскивателя для рта, чтобы изменить микробиом пищевода и экспрессию тканевых генов.
В этом рандомизированном контролируемом исследовании пациенты, которым по клиническим показаниям была назначена эндоскопия, использовали полоскание рта хлоргексидином или не получали никакого лечения в течение 2 недель перед эндоскопией. Мазки из полости рта и слюну собирали в начале и при последующем наблюдении, а в день эндоскопии брали пробы из пищевода. Микробиом анализировали с помощью секвенирования гена 16S рРНК, а экспрессию генов в ткани пищевода определяли с помощью RNA-Seq.
Двадцать субъектов были зарегистрированы и включены в анализы. У отдельных людей состав микробиома полости рта и пищевода был значительно коррелирован. Лечение хлоргексидином связано со значительными изменениями относительной численности нескольких таксонов бактерий пищевода и экспрессии генов в пищеводе, включая снижение уровня периостина, клаудина-18, хемокинов CXCL1 и CXCL13, а также нескольких представителей суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли. Таксон рода Haemophilus в пищеводе также связан со значительными изменениями экспрессии тканевых генов.
Микробиомы полости рта и пищевода тесно связаны у отдельных людей, и изменения микробиома пищевода коррелируют с изменениями экспрессии генов в тканях. Микробиом пищевода может выступать в качестве важного кофактора, влияющего на патогенез и исходы таких заболеваний, как эозинофильный эзофагит, гастроэзофагеальный рефлюкс и пищевод Барретта.
Авторы исследования: Medini K Annavajhala, Michael May, Griselda Compres, Daniel E Freedberg, Roseanna Graham, Stephania Stump, Jianwen Que, Tal Korem, Anne-Catrin Uhlemann, Julian A Abrams
Отзывы пациентов на chlorhexidine