Низкие уровни производного аминокислоты гомоаргинина в сыворотке крови были связаны с повышенным риском общей и сердечно-сосудистой смертности. Дефицит гомоаргинина может быть связан с заболеваниями почек и сердца, но патофизиологическая роль гомоаргинина и генетическая регуляция его уровня в сыворотке крови в значительной степени неизвестны. Методы и результаты: У 3041 пациента Людвигсхафенского исследования риска и сердечно-сосудистого здоровья (LURIC), направленного на коронарную ангиографию, и 2102 участников Исследования молодых финнов (YFS) мы провели общегеномное ассоциативное исследование для выявления геномных локусов, связанных с уровнями гомоаргинина в сыворотке крови, и протестировали ассоциации идентифицированных однонуклеотидных полиморфизмы, связанные со смертностью в ЛУРИКЕ. Мы обнаружили общегеномные значимые ассоциации с уровнями гомоаргинина в сыворотке крови на хромосоме 2 в локусе карбамоилфосфатсинтетазы I, на хромосоме 5 в локусе аланин-глиоксилатаминотрансферазы 2 и на хромосоме 15 в локусе глицинамидинотрансферазы, а также предполагаемую ассоциацию на хромосоме 6 в субъединице медиаторного комплекса Homo sapiens. 23 ген/локус аргиназы I. Все локусы ферментов, расположенных в митохондриях, участвуют в метаболизме аргинина. Самая сильная ассоциация наблюдалась для rs1153858 в локусе глицинамидинотрансферазы со значением P 1,25E-45 в комбинированном анализе и была воспроизведена как в исследовании Die Deutsche Diabetes Dialyse Studie (исследование 4D), так и в исследовании Graz Endocrine Causes of Hypertension (GECOH).
В нашем общегеномном исследовании ассоциаций мы идентифицировали 3 хромосомных участка, значительно ассоциированных с гомоаргинином в сыворотке крови, и еще один участок с предполагаемой ассоциацией, что дает новое представление о генетической регуляции гомоаргинина.
Авторы исследования: Marcus E Kleber, Ilkka Seppälä, Stefan Pilz, Michael M Hoffmann, Andreas Tomaschitz, Niku Oksala, Emma Raitoharju, Leo-Pekka Lyytikäinen, Kari-Matti Mäkelä, Reijo Laaksonen, Mika Kähönen, Olli T Raitakari, Jie Huang, Katharina Kienreich, Astrid Fahrleitne