Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь (ГЭРБ), регургитация желудочных кислот, часто сопровождающаяся изжогой, поражает до 20% населения в целом. Генетическая предрасположенность подозревается в результате исследований близнецов и семей, но усилия по поиску генов до сих пор были скудными, и не сообщалось ни о каком убедительном исследовании всего генома. Мы использовали данные, полученные из выборок общей популяции, и изучили симптомы рефлюкса, о которых сообщали сами, в зависимости от генотипов однонуклеотидного полиморфизма (SNP) по всему геному.
Мы провели метаанализ GWAS трех независимых популяционных когорт из Швеции, Финляндии и Великобритании. Случаи ГЭРБ (n=2247) и бессимптомная контрольная группа (n=4503) были идентифицированы с использованием данных о симптомах, полученных с помощью вопросника. После строгого контроля качества данные о генотипе для более чем 2,5 Млн маркеров были использованы для ассоциативного тестирования. Биоинформационная характеристика областей генома, связанных с ГЭРБ, включала анализ обогащения набора генов (GSEA), прогнозирование in silico влияния генетического риска на экспрессию генов и вычислительный анализ сигнатур экспрессии генов, индуцированных лекарственными средствами, с использованием Карты связности (cMap). Ключевые результаты: Мы идентифицировали 30 локусов риска, связанных с ГЭРБ (P≤5×10-5), с соответствующими эффектами риска во всех когортах, и предсказали функциональные эффекты на экспрессию генов в соответствующих тканях. GSEA выявила участие генов риска развития ГЭРБ в биологических процессах, связанных с регуляцией ионных каналов и клеточной адгезии. Согласно анализу cMap, омепразол оказывал значительное влияние на экспрессию генов риска развития ГЭРБ, в то время как противотуберкулезные и противовоспалительные препараты набрали наибольшее количество баллов среди повторно используемых соединений.
Мы сообщаем о крупномасштабном генетическом исследовании ГЭРБ и выделяем гены и пути, которые способствуют дальнейшему пониманию его патогенеза и терапевтических возможностей.
Авторы исследования: F Bonfiglio, P G Hysi, W Ek, V Karhunen, N V Rivera, M Männikkö, H Nordenstedt, M Zucchelli, F Bresso, F Williams, H Tornblom, P K Magnusson, N L Pedersen, J Ronkainen, P T Schmidt, M D’Amato
Отзывы пациентов на omeprazole