В общегеномных ассоциативных исследованиях (GWAS) не было выявлено ни одного однонуклеотидного полиморфизма (SNP), специфичного для агрессивного рака предстательной железы.
Чтобы проверить, могут ли SNP, связанные с другими признаками, также влиять на риск агрессивного рака предстательной железы. Дизайн, условия и участники: SNP, вовлеченные в любой фенотип, отличный от рака предстательной железы (p≤10(-7)), были идентифицированы с помощью каталога опубликованных GWAS и протестированы в 2891 агрессивном случае рака предстательной железы и 4592 контрольных группах из Консорциума когорт рака молочной железы и предстательной железы (BPC3). 40 наиболее значимых SNP были прослежены в 4872 случаях агрессивного рака предстательной железы и 24 534 контрольных случаях из Группы Ассоциации рака предстательной железы для изучения связанных с раком изменений в Геноме (ПРАКТИЧЕСКИЙ) консорциум. Измерения результатов и статистический анализ: были оценены отношения шансов (ORs) и 95% доверительные интервалы (CIs) для агрессивного рака предстательной железы. Результаты и ограничения: BPC3 оценил в общей сложности 4666 SNP. Два сигнала были замечены в регионах, о которых уже сообщалось о риске рака предстательной железы. rs7014346 в 8q24.21 был незначительно связан с агрессивным раком предстательной железы в исследовании BPC3 (p= 1,6×10(-6)), тогда как после мета-анализа PRACTICAL суммарный OR составил 1,21 (95% ДИ 1,16-1,27, р=3,22×10(-18)). rs9900242 в 17q24.3 также был незначительно связан с агрессивным заболеванием в мета-анализе (ОР 0,90, 95% ДИ 0,86-0,94, р=2,5×10(-6)). Ни один из этих SNP не оставался статистически значимым при кондиционировании на коррелированных известных SNP рака предстательной железы. Метаанализ BPC3 и PRACTICAL выявил третий многообещающий сигнал, отмеченный rs16844874 во 2q34, независимый от известных локусов рака предстательной железы (OR 1,12, 95% ДИ 1,06-1,19, p= 4,67×10(-5)). Было показано, что SNP, коррелирующие с этим сигналом, влияют на концентрацию глицина.. Основным ограничением является неоднородность в определении агрессивного рака предстательной железы между BPC3 и PRACTICAL.
Мы не выявили новых SNP для агрессивного рака предстательной железы. Однако rs16844874 может предоставить предварительные генетические доказательства роли глицинового пути в этиологии рака предстательной железы. Резюме пациента: Мы оценили, связаны ли генетические варианты, связанные с несколькими признаками, с риском агрессивного рака предстательной железы. Никаких новых таких вариантов выявлено не было.
Авторы исследования: Orestis A Panagiotou, Ruth C Travis, Daniele Campa, Sonja I Berndt, Sara Lindstrom, Peter Kraft, Fredrick R Schumacher, Afshan Siddiq, Stefania I Papatheodorou, Janet L Stanford, Demetrius Albanes, Jarmo Virtamo, Stepha